UE
Advanced image processing
Description
L'objectif de ce cours est d'approfondir les connaissances théoriques et les compétences pratiques des étudiants en traitement d'images sur la base des compétences qu'ils ont acquises dans les cours de biologie structurale précédents. Ce cours fournit une expérience pratique dans l'exploitation de données et la détermination de la structure 3D de complexes macromoléculaires in vitro ou visualisés directement in situ, à l'intérieur de la cellule. Ce cours apprendra aux étudiants à maîtriser les logiciels utilisés actuellement pour le traitement des données par la communauté scientifique en microscopie et leur permettra d'atteindre le niveau de compétences requis pour pouvoir poursuivre efficacement leurs études dans des équipes de recherche publique ou dans l'industrie.
Compétences requises
Connaissance des techniques de cryo-EM et du traitement d'images de base acquises dans le cadre des cours de master précédents.
Compétences visées
- capacité à traiter et à analyser différents types de données de cryo-EM
- capacité à travailler avec des données expérimentales réelles, à évaluer leur qualité, à identifier et à résoudre leurs limites et leurs problèmes
- capacité à concevoir un pipeline de traitement des données adapté à une expérience donnée
- capacité à interpréter les résultats du traitement et la structure 3D dans le contexte des résultats de recherche obtenus par d'autres méthodes
Discipline(s)
- Biochimie et biologie moléculaire
- Biologie cellulaire
- Informatique
Autres contacts
Florian Faessler : ffaessler@unistra.fr