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Description

Principes théoriques : résolution en microscopie, principes de la microscopie confocale.

Applications: réglages d’un microscope confocal (billes de calibration, alignement optique, choix des filtres, réglage des photomultiplicateurs et de l’épaisseur des coupes optiques,
compensation de fluorescence).

Principes théoriques : principes de fluorescence, principes de l’imagerie calcique, comparaison des caractéristiques de différents microscopes confocaux.

Applications: acquisition d’images en 3D en simple, double et triple marquage, acquisition d’images en mode "time-lapse", imagerie du calcium.

Principes théoriques : image numérique et dynamique des images, principes de la co-localisation et apport de la déconvolution des images.

Analyse des images: calculs de co-localisation, déconvolution par PSF estimée ou calculée, calcul de fluorescence au cours du temps, mesure du calcium intracellulaire.

Compétences requises

La participation à cette formation ne nécessite pas de pré-requis spécifiques au regard du public auquel elle s’adresse.

Compétences visées

  • Choisir les fluorochromes les plus appropriés
  • Régler les différents paramètres d’un microscope confocal
  • Observer en microscopie confocale des cellules vivantes ou fixées
  • Effectuer des expériences en double/triple marquage
  • Effectuer des reconstructions 3D et des calculs de co-localisation
  • Comprendre les avantages et limites du marquage transgénique de protéines par la GFP (Green Fluorescent Protein), ses dérivés (CFP, YFP, mCherry, mRFP)
  • Effectuer des expériences d’imagerie du calcium

Modalités d'organisation et de suivi

La formation est fondée sur une alternance de cours théoriques (le matin), de travaux pratiques et d’analyse des images (l’après-midi). Un support de formation sera remis aux participants sous format papier et/ou numérique au début de la formation.

Contact

Responsable(s) de l'enseignement
Philippe Ronde : philippe.ronde@unistra.fr