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Description

L’objectif de l’enseignement est de présenter des concepts et applications avancées de la modélisation moléculaire en science du vivant.

  • Introduction aux structures des protéines et des acides nucléiques
  • Relation entre structure, dynamique et fonction
  • Interactions macromoléculaires
  • Introduction à la thermodynamique statistique, modélisation moléculaire des systèmes biologique par champ de force classique toute-atome (Molecular Mechanics)
  • Introduction à la dynamique moléculaire (Molecular Dynamics)
  • Analyse de modes normaux de vibration (Normal Mode Analysis)
  • Prédiction de l’affinité de liaison ligand/protéine (ligand binding affinity) par méthodes de simulation
  • Savoir appliquer ces concepts à la modélisation des biomolécules fonctionnelles avec introduction aux logiciels de modélisation et leur utilisation.

Compétences visées

Les étudiants acquerront des compétences théoriques et pratiques approfondies en chimie physique et informatique à l’interface avec la biologie.

Contact

Responsable(s) de l'enseignement
Roland Stote : rstote@unistra.fr
Marco Cecchini : mcecchini@unistra.fr