Bio-puces

Compétences requises

Cours/TP en 1A et 2A (TICS) en biologie, Cours sur les omiques (2A-TICS)

--

Biology (1A and 2A TICS) - Omics (2A-TICS)

Compétences visées

Ce volet de l’UE s’intéresse aux puces à ADN et aux puces à protéines. Les étudiants apprennent les techniques de base en biotechnologie permettant la fabrication d'une biopuce ADN. Un déplacement est prévu au Centre Inter-universitaire de MicroElectronique et Nanotechnologies (CIME/Minatec) à Grenoble pour leur permettre de mettre en applications leurs compétences acquises dans ce domaine.

• Compétences technologiques permettant l’élaboration des puces à ADN
• Maitrise des outils professionnels associés au domaine des BioChip.

--

This course is focused on DNA chips and protein chips. Students learn biotechnology technics  for the conception of a DNA biochip. A trip is planned at the Inter-University Centre for Microelectronics and Nanotechnology (ICEM) in Grenoble to allow them to put in their applications skills in this area.

• Technological skills enabling the development of DNA chips
  
• Mastery of professional tools associated with the field of BioChip.

Syllabus

2 séances de cours

• 1ère séance : L’hybridation moléculaire et l’amplification par PCR (Polymerase Chain Reaction).
• 2ème séance : Études détaillées des protocoles d’élaboration des puces à ADN.

Travaux pratiques
Pendant 4 demi-journées consécutives, les étudiants travaillent sur la plateforme Biochip (dédiée à la biotechnologie) située au centre CNFM de Minatec et réalisent une puce ADN au travers du TP  du CIME intitulé « BioChips: DNA Microarray Technology: fabrication and  applications ».

Contenu du TP composé de 2 parties:

• 1ère partie: l'ADN est extrait à partir d'un échantillon de bactéries, puis amplifié, labellisé par fluorescence et hybridé pendant une nuit sur une micro-puce à ADN d'oligonucléotide.
• 2ème partie: Après le lavage, la fluorescence associée à chaque sonde sera détectée et analysée. Le Spotting d'une puce à ADN par un robot sera traité.

--

This practical work consists of two parts that will take place at the Interuniversity Center for  MicroElectronics (CIME-CNFM), Minatec Grenoble.

For 4 consecutive half days, students work on the Biochip platform (dedicated to biotechnology).

• 1rst Part – DNA microarray: DNA will be extracted from a bacterial sample, amplified, fluorescently labelled and hybridized overnight to an oligonucleotide microarray.
• 2nd part – DNA microarray: after washing, the fluorescence associated with each oligonucleotide probe will be detected and analyzed. Spotting of a microarray by a robot will be demonstrated.

Contact